Vienna Ab initio Simulation Package to pakiet do wykonywania obliczeń mechaniki kwantowej ab initio przy użyciu pseudopotencjałów Vanderbilta lub metody fali rozszerzonej projektora i zestawu podstawy fali płaskiej. Podstawową metodologią jest teoria funkcjonału gęstości (DFT), ale kod pozwala również na użycie poprawek post-DFT, takich jak mieszanie funkcjonałów hybrydowych DFT i wymiana Hartree-Focka (np. HSE, PBE0 lub B3LYP), teoria perturbacji wielu ciał (metoda GW) oraz dynamiczne korelacje elektronowe w ramach aproksymacji fazy losowej (RPA) i MP2.
¶ Dostępne wersje
VASP/5.4.4-intel2021a
VASP/5.4.4-patch4-intel2021a
VASP/5.4.4-vtst198-intel2021a
VASP/5.4.4-wannier90-intel2021a
VASP/6.2.0-intel2021a
VASP/6.4.0-intel2022a
VASP/6.4.2-16Feb24-intel2022a
VASP/6.4.2-intel2022a
VASP/6.5.0-intel2022a
¶ Warunki dostępu
Wymagania:
- konto na platformie e-science.pl
- aktywna usługa "Przetwórz na Superkomputerze"
- własna licencja
Jeśli nie spełniasz powyższych wymagań kliknij tutaj.
¶ Licencja
¶ Uzyskanie licencji i dostępu do programu w WCSS
VASP jest dostępny tylko dla posiadaczy własnej licencji. Użytkownik musi zgłosić chęć korzystania na adres kdm@wcss.pl, podając numer swojej licencji oraz adres e-mail, na którym jest licencja.
Dostęp jest przyznawany po pozytywnej weryfikacji.
VASP 6.5 dostępny jest wyłącznie dla użytkowników z aktywną licencją.
¶ Sposób użycia
¶ Jak zlecić zadanie
Zadania obliczeniowe należy uruchamiać za pośrednictwem systemu kolejkowego SLURM.
Przykładowa komenda do zlecenia zadania z plkiem wsadowym plik:
sub-vasp-6.4.0 plik -c 12 -m 150 -t 8
¶ Subskrypty
Do wstawiania zadań do systemu kolejkowego służy polecenie:
sub-vasp-5.4.4
sub-vasp-5.4.4-vtst
sub-vasp-6.2.0
sub-vasp-6.4.0
sub-vasp-6.4.2
sub-vasp-6.5.0
Uruchomienie skryptu bez podania argumentów wyświetli podpowiedź, jak należy te argumenty wyspecyfikować:
sub-vasp-6.4.0
Usage: /usr/local/bin/bem2/sub-vasp-6.4.0 FILE PARAMETERS
Parameters:
-p PARTITION Set partition (queue). Default = normal
-n NODES Set number of nodes. Default = 1
-c CORES Up to 48. Default = 1
-m MEMORY In GB, up to 180 (must be integer value). Default = 2
-t TIME_LIMIT In hours. Default = 12
Subskrypty należy uruchamiać wyłącznie na węźle dostępowym ui.wcss.pl
¶ Moduły
¶ Sprawdzenie dostępnych wersji
W zadaniu interaktywnym wylistuj dostępne moduły ORCA poleceniem:
module avail -i vasp
¶ Ładowanie modułu
Załadowanie modułu w powłoce:
module load VASP/6.4.2-intel2022a`
¶ Informacje o wykorzystaniu
¶ Podziękowania dla autorów oprogramowania
W przyszłych publikacjach prac wykonanych z wykorzystaniem VASP użycie oprogramowania powinno zostać zaznaczone, przykład (odpowiednio do języka publikacji):
Obliczenia wykonano z wykorzystaniem Vienna ab-initio simulation package VASP.X.x [1,2].
1 G. Kresse and J. Furthmüller, Phys. Rev. B 54, 11 169 (1996).
The calculations have been performed using the Vienna ab-initio simulation package VASP.X.x [1,2].
1 G. Kresse and J. Furthmüller, Phys. Rev. B 54, 11 169 (1996).
Jeżeli wykorzystuje się potencjały PAW, należy odnieść się do:
2 G. Kresse and D. Joubert, Phys. Rev. B 59, 1758 (1999).
W przypadku zastosowania specjalnych funkcji zaimplementowanych w VASP należy przytoczyć odpowiednie publikacje wymienione w dokumentacji VASP.
¶ Podziękowania dla WCSS
Wszelkie publikacje, w tym prace doktorskie i dyplomowe, wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji) zgodnej z aktualnie obowiązującym regulaminem.
¶ Zobacz również
¶ Mam problem z...
- Brak konta e-science Jeśli nie masz konta e-science zarejestruj się.
- Brak usługi Przetwórz na Superkomputerze Złóż wniosek o nową usługę lub modyfikację istniejącej.
¶ Dokumentacja VASP
¶ Dokumentacja KDM
- Jak uzyskać dostep do Superkomputera?
- Rejestr zużycia zasobów Jak sprawdzić dostępne zasoby w usłudze
- HPC info Szczegółowe informacje o użyciu zasobów w zadanich i usługach
- Subskrypty specjalne przygotowane skrypty do uruchamiania poszczególnych wersji danego programu
- Partycje lista partycji GPU i sprawdzanie dostępności węzłów
- Moduły Jak korzystać z polecenia module
- Uruchamianie zadań w sytemie kolejkowym SLURM
Pełna wersja dokumentacji użytkownika WCSS znajduje się tutaj.
Jeśli nie znajdziesz rozwiązania w powyżej dokumentacji, prosimy o kontakt z kdm@wcss.pl lub pod telefonem 71 320 47 45