CRYSTAL to program do przewidywania właściwości kryształów. Aplikacja pozwala na wyznaczenie struktury elektronowej układów periodycznych takimi metodami jak: metoda Hartree-Fock'a, metody wychodzące poza przybliżenie cząstek niezależnych (projekt CRYSCOR-MP2) oraz metodami bazującymi na teorii funkcjonału gęstości (DFT). CRYSTAL przewiduje właściwości cząsteczek, polimerów, powierzchni oraz kryształów.
Główne cechy pakietu CRYSTAL:
crystal/17_1.0.2-intel_2022a
Zadania obliczeniowe należy uruchamiać za pośrednictwem systemu kolejkowego SLURM. Przykład uruchomienia zadania interaktywnego:
srun --time=6:00:00 --pty bash
Do prostego ustawiania środowiska programu należy skorzystać z mechanizmu modułów. Załadowanie modułu w powłoce:
module load crystal/17_1.0.2-intel_2022a
Do wstawiania zadań do systemu kolejkowego służy polecenie:
sub-crystal-17_1.0.2
Uruchomienie skryptu bez podania argumentów wyświetli podpowiedź jak należy te argumenty specyfikować:
sub-crystal-17_1.0.2
Usage: /usr/local/bin/bem2/sub-crystal-17_1.0.2 [PARAMETERS] INPUT_FILE.d12 INPUT_FILE2.d3
Parameters:
-p PARTITION Set partition (queue). Default = normal
-n NODES Set number of nodes. Default = 1
-c CORES Up to 48. Default = 1
-m MEMORY In GB, up to 180 (must be integer value). Default = 2
-t TIME_LIMIT In hours. Default = 8
-e exec Crystal17 execution mode, available options: runmpi17, runmpi_prop17 Default = runmpi17
Wszelkie publikacje, w tym prace doktorskie i dyplomowe, wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji):
"Opracowano przy użyciu zasobów udostępnionych przez Wrocławskie Centrum
Sieciowo-Superkomputerowe (http://wcss.pl)”
"Created using resources provided by Wroclaw Centre for Networking and
Supercomputing (http://wcss.pl)"