¶ Spanish Initiative for Electronic Simulations with Thousands of Atoms
SIESTA to pakiet oprogramowania do przeprowadzania obliczeń DFT. Dzięki autorskiej implementacji umożliwia obliczanie bardzo dużych układów w rozsądnym czasie. Stosuje się go tam, gdzie kosztowne metody, wymagające obliczania funkcji falowych wszystkich elektronów, byłyby nieefektywne.
¶ Warunki dostępu
- konto na platformie e-science.pl
- aktywna usługa "Przetwórz na Superkomputerze"
Jeśli nie spełniasz powyższych wymagań kliknij tutaj.
¶ Licencja
Od 13 maja 2016 roku, wraz z ogłoszeniem wersji 4.0, SIESTA jest udostępniana na warunkach licencji open source GPL.
¶ Sposób użycia
Zadania obliczeniowe należy uruchamiać za pośrednictwem systemu kolejkowego SLURM
lub za pomoca sub-skryptów.
¶ Informacja o wykorzystaniu
Jeśli w swoich obliczeniach korzystasz z programu SIESTA, pamiętaj o odpowiednim cytowaniu jego autorów. Zalecane jest przywołanie głównej publikacji opisującej metodę i implementację:
Artacho, E. , Sánchez‐Portal, D. , Ordejón, P. , García, A. and Soler, J. M. (1999), Linear‐Scaling ab‐initio Calculations for Large and Complex Systems. phys. stat. sol. (b), 215: 809-817. doi:10.1002/(SICI)1521-3951(199909)215:1<809::AID-PSSB809>3.0.CO;2-0
Emilio Artacho, E. Anglada, O. Diéguez, J. D. Gale, A. García, J. Junquera, R. M. Martin, P. Ordejón, J. M. Pruneda, D. Sánchez-Portal and J. M. Soler, The SIESTA method; developments and applicability. Journal of Physics: Condensed Matter, 20 (6), 064208, (2008), url: https://stacks.iop.org/0953-8984/20/i=6/a=064208
José M Soler, Emilio Artacho, Julian D Gale, Alberto García, Javier Junquera, Pablo Ordejón and Daniel Sánchez-Portal, Journal of Physics: Condensed Matter, 14 (11), (2002), url: https://iopscience.iop.org/article/10.1088/0953-8984/14/11/302
¶ Podziękowania dla WCSS
Wszelkie publikacje, w tym prace doktorskie i dyplomowe, wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji) zgodnej z aktualnie obowiązującym regulaminem.
"Opracowano przy użyciu zasobów udostępnionych przez Wrocławskie Centrum Sieciowo-Superkomputerowe (http://wcss.pl)”
"Created using resources provided by Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://wcss.pl)"
¶ Zobacz również
¶ Mam problem z...
- Brak konta e-science.pl Jeśli nie masz konta e-science.pl - zarejestruj się
- Brak usługi "Przetwórz na Superkomputerze" Złóż wniosek o nową usługę lub modyfikację istniejącej
¶ Dokumentacja SIESTA
- SIESTA Strona domowa
- SIESTA Dokumentacja
- The SIESTA method for ab initio order-N materials simulation, J. Phys.: Condens. Matter 14 2745 (2002) Książka
¶ Dokumentacja KDM
- Jak uzyskać dostęp do superkomputera?
- Rejestr zużycia zasobów Jak sprawdzić dostępne zasoby w usłudze?
- HPC info Szczegółowe informacje o użyciu zasobów w zadaniach i usługach
- Sub-skrypty Specjalnie przygotowane skrypty do uruchamiania poszczególnych wersji danego programu
- Partycje Lista partycji GPU i sprawdzanie dostępności węzłów
- Moduły Jak korzystać z polecenia
module? - Uruchamianie zadań Jak uruchomić zadania w systemie kolejkowym SLURM?
Pełna wersja dokumentacji użytkownika WCSS znajduje się tutaj
Jeśli nie znajdziesz rozwiązania w powyżej dokumentacji, prosimy o kontakt z kdm@wcss.pl lub pod telefonem 71 320 47 45