DIRAC to oprogramowanie do obliczeń kwantowo-chemicznych.
Oprogramowanie pozwala obliczać różne właściwości molekularne za pomocą teorii Hartree-Focka , MP2 , teorii funkcjonału gęstości , interakcji konfiguracji i sprzężonych teorii struktury elektronowej klastra. PAM DIRAC wykorzystuje równanie Diraca jako punkt wyjścia.
Wymagania:
Jeśli nie spełniasz powyższych wymagań kliknij tutaj.
Pakiet udostępniany jest na licencji GNU Lesser General Public License v2.1 .
Zadania obliczeniowe należy uruchamiać za pośrednictwem systemu kolejkowego SLURM lub subskryptów
Do wstawiania zadań do systemu kolejkowego służy polecenie:
sub-dirac-19
sub-dirac-22
sub-dirac-23.0
Uruchomienie skryptu bez podania argumentów wyświetli podpowiedź jak należy te argumenty specyfikować:
sub-dirac-23.0
You need to specify input!
Usage: /usr/local/bin/bem2/sub-dirac-23.0 "INPUT" PARAMETERS
INPUT is a string which would be a typical input for Dirac, for example:
/usr/local/bin/bem2/sub-dirac-23.0 "--mol=methanol.xyz --inp=hf.inp" PARAMETERRS
Parameters:
-p PARTITION Set partition (queue). Default = normal
-n NODES Set number of nodes. Default = 1
-c CORES Up to 48. Default = 4
-m MEMORY In GB, up to 180 (must be integer value). Default = 1
-t TIME_LIMIT In hours. Default = 6
--name NAME name for a job
Subskrypty należy uruchamiać wyłącznie na węźle dostępowym ui.wcss.pl
Do uruchomienie programu w trybie interaktywnym należy:
user@ui ~> sub-interactive
Przykład uruchomienia zadania interaktywnego:
srun -I --time=6:00:00 --pty bash
module avail -i DIRAC
Do prostego ustawiania środowiska programu należy skorzystać z mechanizmu modułów. Załadowanie modułu w powłoce:
module load DIRAC/23.0-intel-2022b-int64
Autorzy pakietu DIRAC sugerują umieszczenie w publikacji adnotacji o wykorzystaniu pakietu do przeprowadzenia obliczeń.
zgodnie ze specyfikacją na stronie http://diracprogram.org.
Wszelkie publikacje, w tym prace doktorskie i dyplomowe, wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji) zgodnej z aktualnie obowiązującym regulaminem.
"Created using resources provided by Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://wcss.pl)"
"Opracowano przy użyciu zasobów udostępnionych przez Wrocławskie Centrum Sieciowo-Superkomputerowe (http://wcss.pl)”
Pełna wersja dokumentacji użytkownika WCSS znajduje się tutaj.
Jeśli nie znajdziesz rozwiązania w powyżej dokumentacji, prosimy o kontakt z kdm@wcss.pl.