CPMD to pakiet z dziedziny dynamiki molekularnej, implementujący metodologię Car-Parinello. Pierwszą wersję pakietu napisał Jurg Hutter w laboratorium badawczym IBM w Zurichu, kolejne wersje rozwijane były przy współudziale ludzi i organizacji z całego świata. Od 2022 IBM udostępniło pakiet na licecji MIT.
Główne cechy pakietu CPMD:
cpmd/4.3
CPMD/4.3-intel-2023a
CPMD-4.3-foss-2022a
CPMD/4.3-GCC-13.3.0
CPMD/4.3-GCC-14.2.0
CPMD/4.3-foss-2022a
CPMD/4.3-GCC-14.2.0
Wymagania:
Jeśli nie spełniasz powyższych wymagań kliknij tutaj.
The CPMD program is © 1990-2023 by IBM Corp. and © 1994-2001 by Max Planck Institute, Stuttgart
In 2022, IBM made the CPMD code freely available on GitHub under the MIT License.
Zadania obliczeniowe należy uruchamiać za pośrednictwem systemu kolejkowego SLURM wykorzystując moduły lub subskrypty
Dostępne wersje subskryptów:
sub-cpmd-4.3
sub-cpmd-4.3.new
Uruchomienie skryptu bez podania argumentów wyświetli podpowiedź jak należy te argumenty specyfikować:
Usage: /usr/local/bin/bem2/sub-cpmd-4.3 FILE PARAMETERS
Parameters:
-p PARTITION Set partition (queue). Default = normal
-n NODES Set number of nodes. Default = 1
-c CORES Up to 48. Default = 1
-m MEMORY In GB, up to 180 (must be integer value). Default = 2
-t TIME_LIMIT In hours. Default = 12
user@ui ~> sub-interactive
Przykład uruchomienia zadania interaktywnego:
srun -I --time=6:00:00 --pty bash
module avail -i cpmd
Do prostego ustawiania środowiska programu należy skorzystać z mechanizmu modułów. Załadowanie modułu w powłoce:
module load CPMD/4.3-GCC-13.3.0
Wszelkie publikacje, w tym prace doktorskie i dyplomowe, wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji) zgodnej z aktualnie obowiązującym regulaminem.
"Created using resources provided by Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://wcss.pl)"
"Opracowano przy użyciu zasobów udostępnionych przez Wrocławskie Centrum Sieciowo-Superkomputerowe (http://wcss.pl)”
Pełna wersja dokumentacji użytkownika WCSS znajduje się tutaj.
Jeśli nie znajdziesz rozwiązania w powyżej dokumentacji, prosimy o kontakt z kdm@wcss.pl lub pod telefonem 71 320 47 45