¶ Brilliantly Advanced General Electronic - structure Library
BAGEL to pakiet oprogramowania przeznaczony do obliczeń kwantowo-chemicznych. Unikalne funkcje obejmują analityczne gradienty energii jądrowej CASPT2 i sprzężenia pochodne, relatywistyczne funkcje falowe o wielu odniesieniach oparte na równaniu Diraca oraz implementacje nowatorskich teorii struktury elektronowej. Wszystkie programy są zrównoleglone przy użyciu zarówno wątków, jak i procesów MPI.
¶ Dostępne wersje
- bagel/2023-02-24
- BAGEL/1.2.2-foss-2021a
- BAGEL/1.2.2-foss-2021a
- niedostępny
¶ Warunki dostępu
Wymagania:
- konto na platformie e-science.pl
- aktywna usługa "Przetwórz na Superkomputerze"
Jeśli nie spełniasz powyższych wymagań kliknij tutaj
¶ Licencja
Pakiet udostępniany jest na licencji GNU GPL
¶ Sposób użycia
Zadania obliczeniowe należy uruchamiać za pośrednictwem systemu kolejkowego SLURM, wykorzystując moduły.
¶ Uruchomienie zadania interaktywnego
user@ui ~> sub-interactive
Przykład uruchomienia zadania interaktywnego:
srun -I --time=6:00:00 --pty bash
¶ Sprawdzanie dostępnych modułów
module avail -i bagel
¶ Ładowanie odpowiedniego modułu
Do prostego ustawiania środowiska programu należy skorzystać z mechanizmu modułów. Załadowanie modułu w powłoce:
module load BAGEL/1.2.2-foss-2021a
¶ Polecenie do uruchamiania programu głównego
mpirun BAGEL input.json > output.out
¶ Informacje o wykorzystaniu
¶ Podziękowania dla WCSS
Wszelkie publikacje, w tym prace doktorskie i dyplomowe, wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji) zgodnej z aktualnie obowiązującym regulaminem.
"Opracowano przy użyciu zasobów udostępnionych przez Wrocławskie Centrum Sieciowo-Superkomputerowe (http://wcss.pl)”
"Created using resources provided by Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://wcss.pl)"
¶ Podziękowania dla autorów oprogramowania
Program jest udostępniony na licencji otwartego kodu GPLv3+. Autorzy proszą o zamieszczenie podziękowania:
BAGEL, Brilliantly Advanced General Electronic-structure Library, http://www.nubakery.org under the GNU General Public License.
¶ Zobacz również
¶ Mam problem z...
- Brak konta e-science.pl Jeśli nie masz konta e-science.pl - zarejestruj się
- Brak usługi "Przetwórz na Superkomputerze" Złóż wniosek o nową usługę lub modyfikację istniejącej
¶ Dokumentacja Bagel
- Strona domowa BAGEL
- Dokumentacja pakietu BAGEL
- BAGEL: Brilliantly Advanced General Electronic-structure Library, WIREs Comput Mol Sci (2018)
¶ Dokumentacja KDM
- Jak uzyskać dostęp do superkomputera?
- Rejestr zużycia zasobów Jak sprawdzić dostępne zasoby w usłudze?
- HPC info Szczegółowe informacje o użyciu zasobów w zadanich i usługach
- Sub-skrypty Specjalne przygotowane skrypty do uruchamiania poszczególnych wersji danego programu
- Partycje Lista partycji GPU i sprawdzanie dostępności węzłów
- Moduły Jak korzystać z polecenia
module? - Uruchamianie zadań Jak uruchamiać zadania w systemie kolejkowym SLURM?
Pełna wersja dokumentacji użytkownika WCSS znajduje się tutaj
Jeśli nie znajdziesz rozwiązania w powyżej dokumentacji, prosimy o kontakt z kdm@wcss.pl.