¶ SCM AMS
Amsterdam Modeling Suite (AMS) jest oprogramowaniem służącym do obliczeń metodami wywodzącymi się z teorii funkcjonału gęstości DFT (ang. Density Function Theory). AMS rozwijany jest przez firmę SCM (Software for Chemistry & Materials).
¶ Dostępne wersje
- AMS/2020.103
- AMS/2021.102
- AMS/2022.103
- AMS/2023.104
- AMS/2024.102
- niedostępny jako moduł, ale w ramach subskryptu AMS można wybrać partycję -p
lem-cpu
- niedostępny jako moduł, ale w ramach subskryptu AMS można wybrać partycję -p
lem-gpu
¶
¶ Warunki dostępu
Wymagania:
- konto na platformie e-science.pl
- aktywna usługa "Przetwórz na Superkomputerze"
Jeśli nie spełniasz powyższych wymagań kliknij tutaj.
¶ Licencja
WCSS posiada roczną licencję, która obejmuje następujące pakiety:
- AMS
- ADFGUI
- BANDGUI
- DFTBGUI
- REAXFFGUI
- MOPACGUI
- QEGUI
- GUI
- NBO6
¶ Sposób użycia
Poniższe polecenie służy do przesyłania zadań do systemu kolejki:
sub-ams-2024.102 input_file
Uruchomienie skryptu bez określania argumentów wyświetli informację o tym, jak określić parametry:
[wcss] user@ui ~> sub-ams-2024.102
Usage: /usr/local/bin/bem2/sub-ams-2024.102 FILE PARAMETERS
Parameters:
-p PARTITION Set partition (queue). Default = normal
-n NODES Set number of nodes. Default = 1
-c CORES Up to 48. Default = 1
-m MEMORY In GB, up to 180 (must be integer value). Default = 2
-t TIME_LIMIT In hours. Default = 6
-o OTHER_PARAMETERS additional R parameters. If used must be the LAST option.
Aby wyświetlić wszystkie dostępne wersje, napisz sub-ams i naciśnij dwukrotnie przycisk TAB
[wcss] user@ui ~> sub-ams
sub-ams sub-ams-2022.103 sub-ams-2023.104 sub-ams-2024.102
Sub- skrypty powinny być uruchamiane tylko w węźle dostępowym
ui.wcss.pl.
Aby użyć AMS w zadaniu interaktywnym, musisz załadować odpowiedni moduł.
¶ Sprawdź dostępne wersje
Sprawdzić moduły można tylko podczas sesji interaktywnej, a nie na węźle dostepowym ui (po uruchomieniu zadania interaktywnego)
Lisa dostępnych modułów:
module avail -i AMS
¶ Module load
Avy załadować moduł wpisz:
module load AMS/2024.102
¶ Podziękowania dla WCSS
Wszelkie publikacje, w tym prace doktorskie i dyplomowe, wykorzystujące wyniki obliczeń wykonanych na komputerach WCSS, powinny zawierać podziękowania postaci (odpowiednio do języka publikacji) zgodnej z aktualnie obowiązującym regulaminem.
"Created using resources provided by Wroclaw Centre for Networking and Supercomputing (http://wcss.pl)"
"Opracowano przy użyciu zasobów udostępnionych przez Wrocławskie Centrum Sieciowo-Superkomputerowe (http://wcss.pl)”
¶ Zobacz również
¶ Mam problem z...
- Brak konta e-science Jeśli nie masz konta e-science zarejestruj się.
- Brak usługi Przetwórz na Superkomputerze Złóż wniosek o nową usługę lub modyfikację istniejącej.
¶ Dokumentacja programu
¶ Dokumentacja KDM
- Jak uzyskać dostep do Superkomputera?
- Rejestr zużycia zasobów Jak sprawdzić dostępne zasoby w usłudze
- HPC info Szczegółowe informacje o użyciu zasobów w zadanich i usługach
- Subskrypty specjalne przygotowane skrypty do uruchamiania poszczególnych wersji danego programu
- Partycje lista partycji GPU i sprawdzanie dostępności węzłów
- Moduły Jak korzystać z polecenia module
- Uruchamianie zadań w sytemie kolejkowym SLURM
Pełna wersja dokumentacji użytkownika WCSS znajduje się tutaj.
Jeśli nie znajdziesz rozwiązania w powyżej dokumentacji, prosimy o kontakt z kdm@wcss.pl lub pod telefonem 71 320 47 45