Są to specjalne przygotowane przez administratorów systemu skrypty do uruchamiania poszczególnych wersji danego programu. Skrypty są przygotowane, by prawidłowo skonfigurować środowisko pracy (ładowanie wymaganych modułów, ustawienie zmiennych środowiskowych, alokacja zasobów, dobierania wymaganej wersji oprogramowanie itd.). Dostępne są skrypty w formacie: sub-<nazwa_programu>-<numer_wersji><
, które należy uruchamiać wyłącznie na węźle dostępowym ui.wcss.pl
.
Aktualna ich lista znajduje się poniżej:
sub- sub-cpmd-4.3 sub-namd-2.14
sub-abaqus sub-cpmd-4.3.new sub-nwchem-7.0.2
sub-abaqus-2021 sub-crystal sub-orca
sub-abaqus-2023 sub-crystal-17_1.0.2 sub-orca-4.2.1
sub-abinit sub-dalton sub-orca-5.0.2
sub-abinit-9.4.1 sub-dalton-2020 sub-orca-5.0.3
sub-adf-2021.102 sub-dirac sub-orca-5.0.3-xtb-6.5.0
sub-ams-2022.103 sub-dirac-19 sub-orca-5.0.4
sub-cfour sub-dirac-22 sub-r
sub-cfour-2.1 sub-fds-6.7.6 sub-r-4.1.0
sub-alphafold sub-fluent-2023 sub-raspa
sub-cfour-2.1-serial sub-gaussian sub-raspa-2.0
sub-cfx-2022r1 sub-gaussian-2016-C.01 sub-sprkkr8.6.0-local
sub-comsol-5.6 sub-gromacs sub-turbomole
sub-comsol-5.6-llm sub-gromacs-2021 sub-turbomole-7.6
sub-comsol-6.0 sub-kkrgen8.6.0 sub-vasp
sub-comsol-6.0-llm sub-kkrscf8.6.0 sub-vasp-5.4.4
sub-comsol-6.1 sub-matlab sub-vasp-6.2.0
sub-comsol-6.1-llm sub-matlab-R2021a sub-vasp-6.4.0
sub-cp2k-8.1 sub-matlab-R2022b sub-namd
W celu wyświetlenia pomocy danego skryptu wystarczy wpisać jego nazwę i kliknąć przycisk ENTER. Przykład dla skryptu dla oprogramowania sub-matlab-R2022b
:
login@ui: ~ $ sub-matlab-R2022b
Usage: /usr/local/bin/bem2/sub-matlab-R2022b [PARAMETERS] INPUT_FILE MOLECULE_FILE
Parameters:
-p | --partition PARTITION Set partition (queue). Default = normal
-n | --nodes NODES Set number of nodes. Default = 1
-c | --cores CORES Up to 48. Default = 1
-m | --memory MEMORY In GB, up to 390 (must be integer value). Default = 1
-t | --time TIME_LIMIT In hours. Default = 1